GGM jest samorządową instytucją kultury, dla której prowadzenie działalności kulturalnej jest podstawowym celem statutowym. GGM jest wpisana do Rejestru Instytucji Kultury prowadzonego przez Gminę Miasta Gdańska pod numerem 11/09. Działa na podstawie ustawy z dnia 8 marca 1990 r. o samorządzie gminnym (tj. Dz. U. z 2001 r., nr 142, poz. 1591, z późn. zm.) oraz ustawy z dnia 25 października 1991 r. o organizowaniu i prowadzeniu działalności kulturalnej (tj. Dz. U. z 2012 r., poz. 406). Organizatorem Gdańskiej Galerii Miejskiej jest Gmina Miasta Gdańska. Nadzór nad Gdańską Galerią Miejską, związany z pełnieniem funkcji Organizatora, sprawuje Prezydent Miasta Gdańsk.